MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 112404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003552	GAG	2	6	127427	127432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089001
2502	NC_003552	GGA	2	6	127584	127589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089001
2503	NC_003552	CAT	3	9	127590	127598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089001
2504	NC_003552	GAAG	2	8	127599	127606	50 %	0 %	50 %	0 %	20089001
2505	NC_003552	CTT	2	6	127710	127715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_003552	T	6	6	127714	127719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_003552	CTTCT	2	10	127757	127766	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2508	NC_003552	ATT	2	6	127833	127838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_003552	CAA	2	6	127872	127877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_003552	TAAG	2	8	127919	127926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_003552	AT	3	6	128026	128031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_003552	AAAAG	2	10	128154	128163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_003552	CCT	2	6	128376	128381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_003552	A	7	7	128397	128403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_003552	AAT	2	6	128492	128497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_003552	CT	3	6	128522	128527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_003552	A	6	6	128561	128566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_003552	AAAG	2	8	128690	128697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_003552	CA	3	6	128704	128709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_003552	AAG	2	6	128712	128717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_003552	ATCAA	2	10	128722	128731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2522	NC_003552	AAAC	2	8	128756	128763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2523	NC_003552	T	6	6	128778	128783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_003552	T	6	6	128807	128812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_003552	TTTG	2	8	128830	128837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_003552	T	6	6	128861	128866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_003552	TTCC	2	8	128889	128896	0 %	50 %	0 %	50 %	20089002
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2530	NC_003552	TGC	2	6	129064	129069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089002
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2532	NC_003552	AGGT	2	8	129123	129130	25 %	25 %	50 %	0 %	20089002
2533	NC_003552	AG	3	6	129195	129200	50 %	0 %	50 %	0 %	20089002
2534	NC_003552	TCC	2	6	129233	129238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089002
2535	NC_003552	T	6	6	129251	129256	0 %	100 %	0 %	0 %	20089002
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2539	NC_003552	GTCCT	2	10	129414	129423	0 %	40 %	20 %	40 %	20089002
2540	NC_003552	CTA	2	6	129439	129444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089002
2541	NC_003552	ATA	2	6	129558	129563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_003552	ACT	2	6	129576	129581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_003552	GAAAA	2	10	129621	129630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_003552	TGT	2	6	129664	129669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_003552	TAA	2	6	129733	129738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_003552	AT	3	6	129739	129744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_003552	AT	3	6	129753	129758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_003552	TAA	2	6	129773	129778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_003552	T	6	6	129804	129809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_003552	ATC	2	6	129842	129847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_003552	CTG	2	6	129975	129980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089003
2552	NC_003552	CAG	2	6	129983	129988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089003
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2559	NC_003552	AAGG	2	8	130456	130463	50 %	0 %	50 %	0 %	20089003
2560	NC_003552	GAA	2	6	130481	130486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089003
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2562	NC_003552	TAC	2	6	130511	130516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089003
2563	NC_003552	GAA	4	12	130541	130552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089003
2564	NC_003552	GAT	2	6	130717	130722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_003552	AAT	2	6	130740	130745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_003552	AAT	2	6	130766	130771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_003552	A	6	6	130840	130845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2569	NC_003552	T	6	6	130904	130909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_003552	T	6	6	130918	130923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2573	NC_003552	TTCC	2	8	130961	130968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_003552	GTT	2	6	130973	130978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_003552	TG	3	6	130982	130987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_003552	T	7	7	131086	131092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_003552	CTC	2	6	131093	131098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_003552	T	6	6	131108	131113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_003552	TTTTC	2	10	131116	131125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2580	NC_003552	TCT	2	6	131131	131136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_003552	T	6	6	131136	131141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_003552	TTC	3	9	131160	131168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_003552	ATT	2	6	131178	131183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_003552	CAA	2	6	131321	131326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089004
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2591	NC_003552	CAT	2	6	131622	131627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089004
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2595	NC_003552	CGAG	2	8	132023	132030	25 %	0 %	50 %	25 %	20089004
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2597	NC_003552	T	6	6	132146	132151	0 %	100 %	0 %	0 %	20089004
2598	NC_003552	CTT	2	6	132152	132157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089004
2599	NC_003552	TTC	2	6	132159	132164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089004
2600	NC_003552	GTT	3	9	132189	132197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089004
2601	NC_003552	TAT	2	6	132222	132227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_003552	TAA	2	6	132233	132238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_003552	TCTGA	2	10	132268	132277	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2604	NC_003552	ATA	2	6	132344	132349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_003552	ATT	2	6	132383	132388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_003552	AGA	2	6	132401	132406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_003552	TTCTT	2	10	132424	132433	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2608	NC_003552	AT	4	8	132483	132490	50 %	50 %	0 %	0 %	20089005
2609	NC_003552	CAC	2	6	132654	132659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089005
2610	NC_003552	TTC	2	6	132677	132682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089005
2611	NC_003552	ATG	2	6	132702	132707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089005
2612	NC_003552	AAG	2	6	132887	132892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089005
2613	NC_003552	TCCC	2	8	133002	133009	0 %	25 %	0 %	75 %	20089005
2614	NC_003552	ACA	2	6	133105	133110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089005
2615	NC_003552	GAA	2	6	133134	133139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089005
2616	NC_003552	CTA	2	6	133262	133267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089005
2617	NC_003552	ACC	2	6	133413	133418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089005
2618	NC_003552	GGC	2	6	133470	133475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20089005
2619	NC_003552	TGT	2	6	133532	133537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089005
2620	NC_003552	GCCC	2	8	133590	133597	0 %	0 %	25 %	75 %	20089005
2621	NC_003552	CT	3	6	133611	133616	0 %	50 %	0 %	50 %	20089005
2622	NC_003552	A	7	7	133821	133827	100 %	0 %	0 %	0 %	20089005
2623	NC_003552	GTTCAG	2	12	133847	133858	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2624	NC_003552	GTTCAG	2	12	133865	133876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2625	NC_003552	GTTCAG	2	12	133883	133894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2626	NC_003552	GA	3	6	133940	133945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_003552	TC	3	6	133965	133970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2628	NC_003552	TAT	2	6	133984	133989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_003552	TCTT	2	8	133990	133997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2630	NC_003552	T	7	7	133996	134002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2632	NC_003552	GCC	2	6	134098	134103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20089006
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